NaturegeneticsGTF2
版WHO将胸腺上皮肿瘤分为胸腺癌和胸腺瘤,胸腺瘤又分为A、AB、B1、B2和B3(及少量其他类型)。其中A和AB型胸腺瘤10年生存率接近%,而胸腺癌10年生存率50%。然而,WHO分类缺乏明确的区分标准,造成不同医师和研究间结论的不一致。
本研究来自美国国立癌症研究所,对28例胸腺上皮肿瘤进行二代测序分析,发现GTF2I基因上的错义突变在A型胸腺瘤发生频率很高。由此入手,发现了这种突变与癌基因突变正好相反,在A和AB型胸腺瘤(低侵袭力)发生率远远高于B1/2/3型胸腺瘤和胸腺癌(高侵袭力),有助于区分良恶性胸腺瘤。
研究者对28例胸腺上皮肿瘤进行外显子测序分析,发现胸腺癌突变频率显著高于胸腺瘤,同时常见癌基因突变在胸腺癌中发生率更高,胸腺癌常存在多种癌基因突变,而胸腺瘤中如存在癌基因突变,也多为单一的。研究者进一步发现在A和AB型胸腺瘤中有一个基因存在高频突变,即GTF2I,且突变位点也高度一致,即7号染色体TA。这种突变仅局限于肿瘤组织,在正常DNA中不存在。
进一步扩大临床样本,发现A和AB型胸腺瘤中GTF2I突变率在80%左右,远高于其在其它类型中的突变率;同时,突变型患者预后明显好于野生型患者。
体外实验构建GTF2I突变体转染NIH-3T3细胞,观察到突变型GTF2I较野生型明显促进细胞增殖;但对克隆球形成能力没有影响。同时观察到GTF2I基因突变患者的肿瘤标本中其相应蛋白TFII-I明显多于野生型患者。进一步研究发现,这与突变型蛋白降解速度比野生型蛋白缓慢相关,导致蛋白量增加。
首先这样的研究结果可遇不可求,在高通量外显子测序中,28例标本中发现这么特异性的突变,着实很幸运。同时这个突变在低侵袭性胸腺瘤与高侵袭性胸腺瘤(包括胸腺癌)存在如此大的差异,而与预后相关性极大。因此,这种突变对于临床上区分预后好的胸腺瘤具有极其重要的转化价值。
GTF2I基因编码蛋白TFII-I参与调控细胞增殖(如c-FOS基因)、周期(如CyclinD1)和发育等基因转录。研究发现其突变在A和AB型(低侵袭性和好预后)胸腺瘤频率较高,而在高侵袭性胸腺瘤和胸腺癌中突变率低。突变对蛋白本身的影响是,缓解其降解,稳定蛋白。体外功能学实验鉴定突变GTF2I对NIH-3T3细胞具有促增殖作用,但不具有像癌基因那样的转化能力。突变GTF2I促进胸腺上皮细胞增殖,但尚不具有恶性转化能力,因此表现为低侵袭性胸腺瘤,而不是胸腺癌。
当然,为什么高侵袭力胸腺肿瘤(包括胸腺癌)中GTF2I基因突变比例没有那么高?研究者还不能很好的回答。给的两个解释模型:1.GTF2I基因突变是一种独立的提示好预后的分子事件,与组织学分型没有直接相关性;2.GTF2I基因突变是肿瘤发生的早期事件,随着肿瘤恶变,癌基因突变积累,早期GTF2I突变的肿瘤细胞在克隆进化选择过程中,被增殖能力更强,恶性程度更大的肿瘤细胞取代,导致突变比例减少。
原文:
IacopoPetrinietal.,AspecificmissensemutationinGTF2Ioccursathighfrequencyinthymicepithelialtumors,publishedonline29June
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